A Coimbra Rede de Museus foi fundada em 2013 com a missão de contribuir para o dinamismo cultural da cidade e do país, articulando, cooperando e partilhando responsabilidades e recursos entre os parceiros. Nessa data, oito entidades assinaram, então, o protocolo de cooperação: a Câmara Municipal de Coimbra (com o Museu Municipal de Coimbra), a Universidade de Coimbra (com o Museu da Ciência), o Turismo da UC (com o Museu Académico e o Jardim Botânico), a Direção Geral do Património Cultural (com o Museu Nacional de Machado de Castro), a Direção Regional de Cultura do Centro (com o Mosteiro de Santa Clara-a-Velha), a Fundação Bissaya Barreto (com a Casa-Museu Bissaya Barreto), o Carmelo de Santa Teresa (com o Memorial Irmã Lúcia), a Santa Casa da Misericórdia (com o Museu da Santa Casa) e a Águas de Coimbra (com o Museu da Água).
Os novos membros, detentores de espaços museológicos, visitáveis e de um património de relevante interesse para a divulgação da história da cidade, foram contactados em 2018. No ano seguinte, as referidas instituições manifestaram interesse em integrar a Coimbra Rede de Museu. A integração foi decidida em maio de 2022 e formalizada hoje, dia 26 de setembro, no Salão Nobre da Câmara Municipal de Coimbra, na presença do vice-presidente da CM de Coimbra, Francisco Veiga, do vice-reitor da Universidade de Coimbra, Alfredo Dias, da diretora do Museu Nacional de Machado de Castro, Lurdes Craveiro, da diretora regional de Cultura do Centro, Suzana Menezes, do reitor do Seminário Maior de Coimbra, Nuno Santos, do presidente da Mesa Administrativa da Confraria da Rainha Santa Isabel, Joaquim Costa Nora, do presidente da direção da Casa da Infância Doutor Elysio de Moura, Manuel Ferro, do provedor da Santa Casa da Misericórdia, José Vieira, do membro do Conselho Diretivo da Fundação Inês de Castro, Assunção Júdice, do vogal do Conselho de Administração da Águas de Coimbra, Filipe Carrito, da vogal do Conselho de Administração da Fundação Bissaya Barreto, Maria Lúcia dos Santos, e do vice diretor do Memorial e Arquivo Irmã Lúcia, Carlos Miguel Cardoso.
A rede tem dinamizado atividades ligadas a eventos de caráter internacional, como as Jornada Europeias do Património e o Dia Internacional dos Museus, e de 2013 a 2019 foram desenvolvidos vários percursos e visitas com o intuito de divulgar os espólios e edifícios dos museus e dinamizar o património histórico de Coimbra. A sua atividade foi suspensa durante os anos de 2020 e 2021, devido à pandemia COVID-19, mas foi depois retomada em 2022 já contando com a participação ativa dos novos membros, como, por exemplo, no Dia Internacional dos Museus de 2022 e nas Jornadas Europeias do Património, de 2023.
Com a entrada destes novos quatro membros, a Coimbra Rede Museus passa, agora, a ser composta por 12 instituições detentoras de coleções visitáveis com relevante interesse histórico para Coimbra.